Le LIMICS est une unité de recherche publique de l'Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), référencée UMR_S 1142, également affiliée aux universités « Université Sorbonne Paris Nord » (USPN) et « Sorbonne Université » (SU). Le laboratoire LIMICS est spécialisé dans l'informatique médicale et l'ingénierie des connaissances pour la e-santé, principalement dans les domaines

  • des terminologies et ontologies en santé,
  • des dossiers patients sémantiques de santé (appariements de terminologie et de structures de données),
  • de la médiation et de l'intégration sémantique,
  • des entrepôts de données cliniques et qualité de l'information,
  • de l’intelligence artificielle incluant les systèmes d'aide à la décision,
  • des systèmes de santé publique pour la surveillance et l'épidémiologie,
  • de la présentation visuelle des données et des connaissances biomédicales.

Le groupe se compose actuellement de 40 membres permanents (chercheurs, enseignants-chercheurs, praticiens hospitaliers, administratifs), 6 post-doctorants et ingénieurs et 14 doctorants. Il constitue une équipe multidisciplinaire d'informaticiens, de médecins et de pharmaciens. L'équipe a des liens étroits avec l'APHP et le CHU de Rouen qui offrent des opportunités de multiples collaborations avec des médecins / cliniciens pour le développement et l'évaluation des produits de la recherche. Le rayonnement du LIMICS dans les domaines de l'informatique médicale et de l'ingénierie des connaissances pour la e-santé est reconnu sur le plan national et international avec une production scientifique importante donnant lieu à des publications dans des revues scientifiques de haut niveau, le dépôt de brevets, et une participation en tant que partenaire mais également coordonnateur dans de nombreux projets nationaux et internationaux (donc européens).

Le LIMICS a une grande expertise dans le développement de méthodes numériques innovantes permettant la gestion des données et des connaissances complexes dans le domaine de la santé et le développement de systèmes d'aide à la décision pour améliorer la recherche biomédicale, la qualité des soins et la sécurité des patients. Notre approche se caractérise par l'inclusion de la dimension sémantique (connaissance conceptuelle, représentation conceptuelle des données). Le codage et le partage de divers types d'informations provenant de sources hétérogènes, l'extraction de nouvelles connaissances et l'introduction de ces connaissances dans des systèmes informatiques capables de raisonner pour accompagner les décisions médicales pour un bénéfice patient maximal, nécessitent un prérequis, la capacité à partager le sens. Au cours des cinq dernières années, nous nous sommes concentrés principalement sur la représentation et la gestion des connaissances médicales qualitatives, pour le partage des connaissances et l'aide à la décision.

Le LIMICS dispose d'une grande expertise en interopérabilité sémantique, acquise depuis de nombreuses années dans des projets nationaux et européens. Certains membres ont été activement impliqués dans des organisations de normalisation (CEN et ISO, IHE, DICOM, HL7 et CDISC, Snomed International). Il était également partenaire du réseau européen d'excellence SemanticHealthNet, consacré à l'interopérabilité sémantique dans les soins de santé et du projet ASSESS-CT1 (Assessing SNOMED CT for Large Scale eHealth Deployments in the EU).

DMS-LTIS, Université de Rennes apporte une expertise dans le domaine de l'intégration de données de santé hétérogènes et de leurs réutilisations par des méthodes de fouille de données.

Le Centre de Données Clinique du CHU de Rennes est une plateforme hospitalo-universtaire qui propose une expertise et des services visant à exploiter les données de santé pour l'établissement dans l'environnement technologique eHOP.

Le D2IM (Département de l'Informatique et de l'Information Médicale) du CHU de Rouen apporte une expertise sur

  • l'indexation de données massives via son annotateur sémantique ECMT,
  • l'alignement multi-terminologique,
  • la gestion des terminologies médicales,

avec la réalisation d'un serveur terminologique HeTOP. A la suite de RAVEL, le D2IM a développé un entrepôt de données sémantique, avec un moteur de recherche multilingue (système ASIS). Une version bêta est opérationnelle depuis novembre 2018 répondant à des cas d'usage variés de la part des cliniciens de l'établissement. Tous ces outils, disponibles en services Web, reposent sur des technologies NoSQL. ECMT & HeTOP sont valorisés par la société Alicante.

Le département WIND de l'APHP développe et maintien l'entrepôt de données de santé de l'APHP depuis 2014. L'intégration des données des 39 sites de l'APHP, aux systèmes d'informations inhomogènes a nécessité la mise au point d'un modèle particulièrement souple et confère à l'équipe une expertise certaine en modélisation d'entrepôt de données. WIND développe également des stratégies d'amélioration de la qualité des données. La création d'un entrepôt de données fédéré au niveau Européen (lors du projet EHR4CR) et plus encore la mise au point d'un modèle commun entre monde hospitalier et monde de la recherche pharmaceutique (projet EHR2EDC) ont permis à l'équipe WIND d'appliquer avec succès cette expertise en création de modèle commun de données, permettant de prendre en compte des données très hétérogènes.

Dans le projet ReMIAMES, WIND sera en charge de la mise en œuvre et l'évaluation des techniques sur son entrepôt de données et de la production de métriques de mesure de la qualité des extractions.

L'IRSAN Institut de Recherche pour la valorisation des données de SANté regroupe des experts issus du monde des études en santé, des médecins, des bio-statisticiens, des épidémiologistes, des data-scientists, des spécialistes du numérique en santé. Il propose des éléments d'information en santé, générés en temps réel à partir des données issu des recherches méthodologiques du groupe Systèmes Complexes et Epidémiologie (SCEPID). L’IRSAN, allie des expertises éprouvées dans de très nombreux domaines de la santé (voir les réalisations ayant pour support méthodologique et technologique l'environnement PeeI : "Plateforme e-Sante & épidémiologie de l'Irsan, à l’ancrage régional de la société au plus près des professionnels de terrain, soucieux d’apporter des analyses pour les professionnels de santé comme pour le grand public.

Dans le projet ReMIAMES, l'IRSAN est en charge du développement de la plateforme d'acquisition, de traitement et de visualisation des données et des connaisances ainsi que du site web intranet et extranet du projet.

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